В январе 1668 г. признанный Киевским митрополитом в пределах Речи Посполитой Антоний (Винницкий) созвал собор духовенства и мирян, избравший на Львовскую кафедру шляхтича Евстафия Свистельницкого, принявшего весной 1668 г. монашество с именем Иеремия и хиротонисанного во епископа 10 мая 1668 г. Сторонники Иосифа (Шумлянского) не сразу стали преобладать в епархии. Так, на епархиальном Соборе в апреле 1669 г. 21 из 37 наместников епархии не признал власти Иосифа (Шумлянского) и поддержал Иеремию (Свистельницкого). В 1673–1674 гг. Иеремия (Свистельницкий) фактически проиграл борьбу за Львовскую кафедру, и с 1674 г. Львовское епископство закрепилось за Иосифом (Шумлянским). В марте 1677 г. епископ Иосиф (Шумлянский) заявил нунцию о намерении принять унию частным образом, объяснив, что раньше этого сделать не смог из-за противодействия оппонента Иеремии (Свистельницкого), названного им «проводником схизматиков». В присутствии римско-католических и униатских иерархов в замковом храме в Варшаве 26 марта 1681 г. епископ Иосиф (Шумлянский) вместе с другими духовными лицами произнёс католическое исповедание веры и поставил подпись под католическим Символом веры. С тех пор вплоть до 1700 г. он проводил подготовительную работу к принятию унии, важным этапом которой стало проведение во Львове в декабре 1694 г. епархиального Собора по вопросу отношения к унии, который не принёс униатам полной победы над православными из-за сопротивления Львовского Успенского братства и поддерживавшей его шляхты. Официальное объявление о принятии унии Львовской епархией епископ Иосиф (Шумлянский) сделал на очередном Соборе духовенства 14 апреля 1700 г. во львовском кафедральном соборе святого Георгия. В мае на Варшавском сейме Иосиф (Шумлянский) произнёс католическое исповедание веры перед королём, нунцием и римско-католическим примасом Речи Посполитой. 11 июля 1700 г. епископ Иосиф (Шумлянский) впервые отслужил литургию с упоминанием филиокве, что стало заключительным актом его открытого присоединения к унии. Ряд приходов не последовали за епископом. Активно противостояли униатской экспансии Манявский Крестовоздвиженский скит и приписанные к нему монастыри: коломыйский Благовещенский (упразднён униатами в 1732 г.), толмачский Михайловский (упразднён униатами в 1732 г.), Угорницкий Михайловский скит (упразднён униатами в 1744 г., стал приписным к униатскому Крылосскому монастырю). Около 1720 г. перешёл в унию Креховский монастырь.