25 августа 1248 г. король отплыл из Эг-Морта на Святую землю; в походе его сопровождали братья и жена, королева Маргарита Прованская. Местом сбора крестоносцев был назначен Кипр; здесь войско задержалось на восемь месяцев (сентябрь 1248 г. – конец мая 1249 г.). Покинув Кипр, флот двинулся к Египту и достиг портового города Дамиетта. Людовик IX Святой первым прыгнул в море и «со щитом на шее, в шлеме и с мечом в руках» бросился на сарацин. Город был взят без больших потерь (5 июня 1249 г.), многие освобождённые христиане примкнули к крестоносцам. Король не стал развивать первый успех, а остался дожидаться подхода основных частей под командованием брата Альфонса, графа Пуатье. Разлив Нила задержал армию в Дамиетте, здесь войско поразила эпидемия (дизентерия, тиф, цинга); тяжело заболел и сам Людовик IX Святой. Тем не менее, в ноябре 1249 г. было решено двигаться к Каиру («убить змею, раздавив ей голову»); к началу зимы армия крестоносцев достигла участка берега, противоположного крепости Эль-Мансура, где султан ас-Салих Айюб разместил свои войска. После двух месяцев позиционной войны и строительства дамбы армия крестоносцев, переправившись через брод, начала наступление. Передовой отряд во главе с братом короля Робертом I, графом Артуа, вместе с рыцарями из Ордена тамплиеров ворвался в Эль-Мансуру, но атака захлебнулась, а Роберт погиб. Основная армия крестоносцев под командованием Людовика IX Святого одержала победу (11 февраля 1250 г.). Вскоре обозначились признаки стратегического поражения: сотни рыцарей погибли, из-за крепости Эль-Мансура путь к Каиру был закрыт, египтяне взяли под контроль Нил и отрезали войско от подкрепления и продовольствия. Ослабленная армия начала отступление к Дамиетте, но была разгромлена в битве при Фарсикуре (6 апреля 1250 г.). Король, в арьергарде защищавший отступающих, его братья и бо́льшая часть войска попали в плен. По условиям перемирия, заключённого в конце апреля 1250 г., король получил свободу в обмен на возвращение египтянам Дамиетты, а за освобождение пленных христиан, в том числе тех, кто находились в плену после пятого Крестового похода, надлежало заплатить 800 тыс. безантов; половину суммы следовало внести до отбытия Людовика IX Святого из Египта. Королеве Маргарите Прованской удалось собрать эти деньги; 6 мая 1250 г. Людовик IX Святой был освобождён. В плену Людовик IX Святой показал пример мужества и христианского благочестия; не испугался угроз пыток и распятия, отказался принести клятву, противоречащую христианской вере; разгневался, когда его люди при выплате выкупа обсчитали мусульман на 20 тыс. ливров. Спокойствием и мудростью он снискал уважение мусульман: Туран-шах II предоставил ему своих врачей; предполагалось, что в его честь будет дан пир, и французский монарх примет в нём участие, но Людовик IX Святой отказался, не желая быть осмеянным (впоследствии в агиографических сочинениях его поведение в плену рассматривалось как образец христианского смирения и добровольного страдания). Людовик IX Святой отплыл в Акру и начал сбор денег для выкупа остальных пленных, запретив вести частные переговоры об освобождении и обещая заплатить за всех. Однако условия договора были нарушены новыми правителями Египта – мамлюками, которые пришли к власти в результате переворота (2 мая 1250 г.): многие пленные и раненые были убиты (те, кто не могли сразу заплатить выкуп или отказывались принять ислам), провиант и военные машины уничтожены.