Тёмно-синий фон мозаик в восточной конхе покрыт растительным орнаментальным декором в виде спиралей аканфа (распространённый в раннюю эпоху мотив). В верхней её части помещена раскрытая раковина. Её внешний край ограничен декоративной лентой; на внутреннем крае находятся изображения Агнца Божия и четырёх голубей по сторонам от Него; к её внешней стороне подвешены шесть золотых инкрустированных камнями крестов. Девять золотых крестов изображены на синем фоне в нижней части конхи. В западной нише были изображения стоявших и опиравшихся на посохи юных пастырей, рядом с ними – тельцов, овец и, как полагают исследователи, птиц. Очевидно, в верхней зоне был представлен такой же, как в восточной нише, декоративный мотив раковины. Стены нартекса и крещальни покрывали мраморные инкрустации в технике opus sectile (фрагменты сохранились в восточной части нартекса). В период епископата Илария (461–468 гг.) к Латеранскому баптистерию были пристроены три боковые капеллы (оратории): Святого Креста (не сохранилась, разрушена в 1588 г.), святого Иоанна Крестителя, апостола Иоанна Богослова. Капелла Святого Креста примыкала к баптистерию Латеранского комплекса с северной стороны, она представляла собой небольшое крестообразное в плане сооружение с четырьмя угловыми многогранными компартиментами. План капеллы связан с её назначением: со времени папы Илария она служила местом хранения Креста Господня – реликвии, до этого находившейся в базилике Санта-Кроче-ин-Джерузалемме. На основании рисунков художника Джулиано да Сангалло (начало XVI в.) и гравюр художника Антонио Лафрери (1568 г.) исследователи составили представление о первоначальном убранстве капеллы Святого Креста. Её купол и люнеты стен украшали фигуративные мозаики, стены были облицованы мрамором в технике opus sectile, а цилиндрические своды рукавов креста покрыты орнаментальным стукковым декором. На рёбрах свода находились фигуры четырёх ангелов, которые несли на поднятых руках медальон, как полагают исследователи, с изображением креста. Мраморный декор стен был разделён на три регистра, на верхних панелях были выложены орнаменты с мотивом креста. Капелла Сан-Джованни-Баттиста (San Giovanni Battista), посвящённая святому Иоанну Предтече, расположена с западной стороны от баптистерия Латеранского комплекса. Так же как капелла Святого Креста, в плане она представляет собой равноконечный крест. Её первоначальный декор полностью утрачен в 1727 г., во время реконструкции, проведённой по заказу монсеньора Микеланджело Маттеи. Мозаики свода известны исследователям по описаниям Панвинио 1570 г. и гравюрам, выполненным Дж. Чампини в конце XVII в. В центре свода, в венце, сплетённом из растений, находился образ Агнца Божия, по рёбрам свода тянулись декоративные ленты, внутри которых были представлены павлины с раскрытыми хвостами, стоящие на сферах, установленных, в свою очередь, на возвышениях. Орнаментальные полосы делили поверхность свода на сегменты разной формы, в них находились изображения растений и птиц. В люнетах на стенах, по сторонам окон, были изображены евангелисты в рост, надписи с их именами, крылатые апокалиптические персонажи (лев, телец, орёл, человек).