На последней, двенадцатой сессии (16 марта 1517 г.) присутствовали папа Лев X и 110 католических прелатов, в том числе 18 кардиналов. За несколько дней до этой сессии, 13 марта, в верхней капелле папского дворца заседала конгрегация, принявшая решения о завершении Собора и о повестке дня последней сессии. Перед этим возник спор между Пьетро Уррьесом, епископом Сиракузским, который был представителем испанского короля на пятом Латеранском соборе, и Аквилейским патриархом Марино Гримани о том, кто из них должен занимать более почётное место. Присутствовавшие на конгрегации кардиналы приняли решение, что участники будут рассаживаться в произвольном порядке, по мере того как они заполнят капеллу. На двенадцатой сессии были подтверждены принятые ещё папами Гонорием III (1216–1227 гг.) и Бонифацием VIII (1294–1303 гг.) постановления о запрете подвергать разграблению дворцы кардиналов во время выборов папы: таков был обычай римской толпы, нападавшей, несмотря на наличие вооружённой охраны, на жилище кандидата в понтифики при первых слухах, в том числе и ложных, о том, что этот кардинал избран на Папский престол. В конституции «Constituti iuxta verbum prophetae», которую зачитал патриарх Марино Гримани, папа подвёл итоги пятого Латеранского собора. Среди результатов Собора были названы установление мира между христианскими государями, преодоление раскола в Римской курии и в церкви, преобразования в курии и упразднение Буржской Прагматической санкции. Этой же конституцией объявлялся сбор налогов для Крестового похода против турок. Затем большинством голосов было принято решение о завершении пятого Латеранского собора, несмотря на то что некоторые его участники полагали, что соборные заседания следует продолжить. Пятый Латеранский собор длился пять лет. Через несколько месяцев после его завершения выступление Мартина Лютера положило начало Реформации. Расколы и смуты в католической церкви бывали и раньше, проводились и преобразования, но на этот раз ожидавшие католический мир потрясения были как никогда тяжёлыми. На пятом Латеранском соборе удалось утвердить первенство папы Римского в церкви и преодолеть угрозы со стороны концилиаризма (позднее они уже не возникали). Примирение с французским королём и урегулирование отношений с католической церковью во Франции были достигнуты путём существенных уступок, реформы же внутри церковной организации оказались непоследовательными и не привели к существенным результатам. Кроме того, на пятом Латеранском соборе отсутствовали большинство неитальянских епископов, так что его статус как вселенского подвергался сомнению. Обновлением католической церкви занимался уже Тридентский собор (1545–1563 гг.) во время успешного развития Реформации и распространения протестантизма в странах Северной Европы.