6 июля 1926 г. хиротонисан во епископа Дмитриевского, назначен викарием Курской епархии. Хиротонию в Крестовоздвиженском монастыре Нижнего Новгорода возглавил Заместитель Патриаршего Местоблюстителя митрополит Сергий (Страгородский; впоследствии Патриарх Московский и всея Руси) в сослужении Печерского епископа Григория (Козлова; впоследствии архиепископ) и Конотопского епископа Иоанна (Доброславина). 16 сентября того же года Иоасаф был арестован по обвинению в «изготовлении и хранении в своей квартире с целью распространения агитационной литературы контрреволюционного содержания», а также за «поминовение во время богослужений бывшего императора, членов царского дома и бывших министров». Приговорён к заключению в исправительно-трудовых лагерях. С осени 1926 г. отбывал наказание в Соловецком лагере особого назначения (СЛОН). В конце 1929 г., после освобождения, направлен на три года в ссылку в Нарымский край. Вернувшись, 19 сентября 1932 г. назначен епископом Пятигорским, а 28 октября того же года – епископом Чебоксарским. От назначений отказался, вероятно, по состоянию здоровья. В 1933 г. вновь приговорён к десяти годам ссылки в Северный край. Проживал в Архангельской области, где познакомился и духовно сблизился с Лукой (Войно-Ясенецким). Здоровье Иоасафа значительно ухудшилось, и его, как инвалида, перевели на жительство под административным надзором в Московскую область. 29 июня (по другим данным, 29 июля) 1934 г. назначен управляющим Могилёвской епархией. В 1936 г. одновременно назначен временноуправляющим Минской епархией. В том же году ушёл на покой по состоянию здоровья и поселился в Белгороде. 16 октября 1936 г. в административном порядке выслан в город Боровичи Ленинградской (ныне Новгородской) области, где проживала его сестра. Через полгода ему разрешили вернуться в Белгород «на покой». 29 января 1937 г. был арестован, содержался в белгородской тюрьме, затем проживал под надзором в Ленинградской области. Затем вновь доставлен по этапу в Курск. Обвинялся в руководстве «белгородской террористической группой», в организации выступлений граждан за открытие церквей и в нелегальном совершении богослужений. Виновным в предъявленных обвинениях в антисоветской деятельности себя не признал, подтвердил, что говорил о гонениях в СССР на церковь, духовенство и верующих. 4 декабря 1937 г. Особой тройкой НКВД по Курской области приговорён к высшей мере наказания и в тот же день расстрелян. Материалы к канонизации Иоасафа были собраны братией киевского Ионинского во имя Святой Троицы монастыря и подчинённого ему Зверинецкого скита. Имя Иоасафа включено в Собор новомучеников и исповедников Российских определением Священного Синода от 17 июля 2002 г.