В 1880 г. по просьбам местных крестьян Никольская церковь вновь стала самостоятельной приходской. В 1902 г. в Городищенском монастыре был построен тёплый храм в честь Рождества Иоанна Предтечи. В 1905–1906 гг. в городе Ораниенбаум (ныне город Ломоносов Ленинградской области) на подворье Городищенского монастыря по проекту Павла Павловича Соколова была построена каменная часовня, освящённая во имя Серафима Саровского, Николая Чудотворца и мученицы Александры (в 1917–1931 гг. – церковь, в 1991 г. возобновлена как часовня). При Городищенском монастыре были открыты училище, школа грамоты для сирот и с 1900 г. – больница. В Богородице-Рождественском соборе, справа от входа, хранилась Городищенская (Шкаплерная) икона Божьей Матери «Семистрельная». Шкаплер – кусочки сукна в виде сердца с вышитым на них именем Божьей Матери. Шкаплер носили на плечах и груди члены католического монашеского братства, которое называлось шкаплерным. После закрытия католического монастыря икона перешла к православным верующим. Также в Городищенском монастыре хранился серебряный позолоченный крест с частицей древа Креста Господня, пожертвованный собору в 1866 г., после кончины наследника цесаревича Николая Александровича. В 1923 г. монастырь был закрыт, в его корпусах разместилась партшкола, в 1926–1936 гг. – санаторий ЦК ВЛКСМ Украины, с 1936 г. – гарнизонный военный госпиталь и санаторий командного состава Киевского особого военного округа. В 1941 г., после оккупации Украины немецкими войсками, в Городищенский монастырь вернулись монахини. В 1944 г. в монастыре проживали настоятельница схимонахиня Херувима и 32 насельницы, в 1951 г. – 54 насельницы, в 1954 г. – 63 насельницы, в 1958 г. – 70 насельниц. После увольнения на покой игуменьи Херувимы (22 апреля 1953 г.) монастырь возглавила бывшая настоятельница Немировского монастыря Винницкой области игуменья Арсения (Диденко). Духовниками обители были: игумен Андрей (Романюк), архимандрит Адриан (Ярошук), архимандрит Алексий (Миронович). 30 июня 1960 г. монастырь был закрыт, сёстры переведены в Сатановский монастырь Городокского района. 28 января 1995 г. Городищенский монастырь был открыт как мужской. 28 января 1997 г. его устав был зарегистрирован Госкомрелигий Украины. Наместником монастыря стал игумен Феодосий (Лукашук). В 2005 г. в Городищенском монастыре проживали около 20 насельников. Часть помещений монастыря занимает облпсихбольница №2. Восстанавливается Богородице-Рождественский собор, в отреставрированной зимней церкви Рождества Иоанна Предтечи (освящена 6 декабря 2001 г.) совершаются ежедневные богослужения. В Городищенском монастыре есть келейный корпус, братская трапезная, столярная и слесарная мастерские, гараж, подсобное хозяйство.