Преподобный облачён в подрясник оливкового цвета, тёмно-коричневую мантию и тёмно-синий параман, на голове куколь, в левой руке развёрнутый свиток с текстом: «Не скорбите убо братiя моя но посему разумейте а... угод.»; надпись на фоне: «пре. Ефремъ Переком. но. чуд.». За фигурой Ефрема вид основанной им Перекомской обители: одноглавый Богоявленский храм с трёхъярусной колокольней, каменная ограда с угловыми башнями и проездными вратами. Икона конца XIX – начала ХХ в. (Новгородский музей-заповедник) также представляет святого в рост на фоне монастыря (в левой части условное изображение храма и колокольни), с надписью: «пр. Ефремъ Переком». Изображения Ефрема (в монашеском облачении, с куколем на голове или на плечах) известны, в основном, в иконографии «Собор Новгородских святых». Почитаемая «старинная» икона такого извода с образом Софии, Премудрости Божьей, находилась «в ризнице Черниговской кафедры», Ефрем был представлен в четвёртом ряду. Он изображён, в частности: предположительно в правой группе на иконе конца XVII в. (Сергиево-Посадский музей-заповедник) – в одном ряду с преподобными Саввой Вишерским и Александром Свирским, в куколе, надпись: «ПРП(д)БНЫЙ ЕРЕМЪ» (может быть, Ефрем Новоторжский?); на образе «Чудотворные иконы и Новгородские святые» 1721 г. из собрания Успенских (Государственный Эрмитаж) – в третьем ряду левой группы, без куколя, с окладистой бородой, надпись на нимбе: «пр Ефремъ пр»; на иконе «Новгородские чудотворцы» 1728 г. письма священника Георгия Алексеева (Третьяковская галерея); на прориси с иконы Собора Новгородских чудотворцев, предстоящих Софии, Премудрости Божьей, XVIII в.; на иконе «Новгородские чудотворцы, с ангелом-хранителем и избранными святыми» первой половины XIX в. (Новгородский музей-заповедник) – справа во втором ряду, в схиме и куколе, с раздвоенной на конце седой бородой и кудрявыми волосами (надпись: «пр(д): Ефремъ перекомскiй»); на эмалевом образе Новгородских чудотворцев 1866 г. в оправе мастера Калины Рябкова, принадлежавшем Филарету (Дроздову) Московскому митрополиту (Сергиево-Посадский музей-заповедник), – справа во втором ряду, руки сложены на груди; на двух иконах «Собор всех святых Новгородских угодников» XIX в. (с поновлениями XX в.) и пяднице конца XIX в. (?) (Ефрем – средовек со свитком в руке, надпись: «св. пр. Ефремъ переком.») из церкви апостола Филиппа в Великом Новгороде. В составе Собора русских святых Ефрем написан в правой группе преподобных на поморских иконах: конца XVIII – начала XIX в. (музей изобразительных искусств Республики Корелия) – средовек с волнистыми волосами и короткой бородой, с благословляющей десницей, куколь на плечах; 1814 г. письма Петра Тимофеева из собрания Церковно-археологического музея Санкт-Петербургской духовной академии (Русский музей) – со свитком в правой руке, надпись: «п ефремъ перекопскiи»; в куколе на иконе первой половины XIX в. из деревни Чаженьга Каргопольского района Архангельской области (Третьяковская галерея).