В одном из посланий он писал: «...Великий грех производит разделение, и те, кто берёт на себя право отделения от митрополита Сергия – законного заместителя митрополита Петра, приносят большой вред и собственному спасению, и Церкви православной. Нет никаких канонических оснований к неподчинению митрополиту Сергию, действия которого не касаются православного вероучения и не нарушают благодатности таинств». С октября 1929 г. проживал в городе Котельнич Нижегородского края. 13 августа 1930 г. назначен на Белгородскую кафедру, однако это назначение было отменено из-за отказа в регистрации местных властей. С 22 февраля 1931 г. – архиепископ Котельнический, викарий Вятской епархии, в отсутствие правящего архиерея являлся управляющим епархией. 2 апреля награждён правом ношения креста на клобуке. В октябре 1932 г. вызван к присутствию в составе зимней сессии Священного Синода 1932/1933 г. В феврале 1933 г. утверждён архиепископом Вятским и Слободским. 16 мая 1934 г. возведён в сан митрополита и переведён на Горьковскую кафедру. Его богослужения отличались величием, покоем и благоговением. Евгений обладал притягательной силой духовной власти и пользовался огромным авторитетом среди прихожан, производил на всех впечатление своим величественным видом, высоким ростом, выразительными глазами. На Пасху 1935 г., которая пришлась на 1 мая, не стал ждать, пока пройдет демонстрация, а поехал после службы в Крестовоздвиженской церкви домой в архипастырском облачении. «Чего нам бояться? – сказал, по воспоминаниям, Евгений в ответ на уговоры. – Надо Бога бояться». 3 мая Евгений был арестован. Проходил по делу вместе с пятью иереями. Его обвинили в том, что он «использовал в контрреволюционных целях церковный амвон, произнеся в ряде церквей города Горького и прилегающих районов проповеди антисоветского содержания». На допросах отверг эти обвинения, заявив, что все читаемые им проповеди были исключительно религиозно-нравственного содержания. 4 ноября 1935 г. приговорён особым совещанием НКВД к трём годам лагерей. Отбывал заключение в Казахстане, в Бидаикском отделении Карагандинского лагеря. Зимой занимался заготовкой льда, летом – прополкой сорняков. Потом был назначен учётчиком-статистиком в канцелярию отделения. 16 сентября 1937 г. арестован в лагере. Евгения обвинили «в контрреволюционной религиозной агитации монархического направления», в проведении нелегальных молений, в распространении акафистов и служении панихид по расстрелянным. 20 сентября вместе с другими заключёнными – игуменами Николаем (Ащепьевым), Евгением (Выжвой), иеромонахом Пахомием (Ионовым) и Стефаном Крейдичем – приговорён Особой тройкой при УНКВД по Карагандинской области к расстрелу. Прославлен архиерейским юбилейным Собором РПЦ 2000 г.