Исследователи полагают, что в вестготской Испании была известна только первая книга поэмы, которая имела хождение под заглавием «Шестоднев» («Hexameron»), или «О сотворении мира» («De creatione mundi»). По просьбе короля Хиндасвинта Евгений III исправил ошибки, возникшие во время переписывания текста, а также составил новую редакцию поэмы, убрав, добавив от себя и перефразировав многие стихи (640 стихов из 755); а также убрал предисловие Драконтия и начал произведение с описания сотворения мира. Вместо предисловия Евгений III добавил составленный им краткий «Шестоднев», написанный под влиянием Драконтия, но являющийся самостоятельным произведением. В него включено описание седьмого дня творения, которое отсутствовало у Драконтия. В редакции Евгения III поэма имеет два предисловия: прозаическое, в форме послания к Хиндасвинту, и поэтическое, в котором Евгений III оправдывается за то, что предпринял переработку чужого труда. «Хвала Богу» в редакции Евгения III пользовалась широкой известностью в эпоху Каролингского возрождения, сохранилась в ряде рукописей IX в. (оригинальный текст в виде цитат содержится лишь в двух флорилегиях IX–X вв.). Евгений III переработал и поэму Драконтия «Оправдание» («Satisfactio»), не только отредактировав её, но и изменив суть произведения, которое было задумано как оправдание перед королём вандалов Гунтамундом. В интерпретации Евгения III поэма превратилась в молитвенное обращение к Богу. Святитель был одним из представителей круга вестготских писателей VI–VII вв. (Леандр и Исидор Гиспальские, Ильдефонс и Юлиан Толетские), творения которых имеют общие черты и могут считаться произведениями одной школы. Евгению III приписывается также около 120 мелких поэтических произведений, объединённых, по свидетельству Ильдефонса, в книгу. По мнению исследователей, авторство некоторых стихотворений принадлежит менее известным вестготским поэтам, современникам Евгения III. Так, они считают, что небольшое стихотворение о базилике св. Викентия в Цезаравгусте, скорее всего, написано епископом Цезаравгусты Иоанном II (619–631 гг.), братом Браулиона. Сохранился также ряд стихов и гимнов, которые были составлены позднее и ложно приписаны Евгению III. Наиболее известен из них гимн в честь священномученика Дионисия Ареопагита, о котором упоминает Гилдуин в Житии Дионисия. В конце IX в. автором этого гимна считался Евгений I, легендарный основатель Толетской кафедры. Ильдефонс среди произведений Евгения III упоминает некую прозаическую книгу, а также трактат о Троице, написанный для христиан Ливии и Востока; как полагают исследователи, первая на латинском Западе попытка полемики с исламом (сочинения не сохранилось).