В убежище была учреждена амбулатория имени великого князя Сергея Александровича, которая обслуживала малоимущее население Сергиевского посада. Во время войны 1914–1918 гг. убежище принимало раненых воинов на лечение, несмотря на свой возраст, за ними ухаживали престарелые сёстры милосердия. Елизавета Фёдоровна спала на деревянной кровати без матраца, с жёсткой подушкой два–три часа в сутки, в полночь молилась в церкви, посещала больных в лазарете. Время, свободное от благотворительных трудов, посвящала паломническим поездкам. Она неоднократно посещала Троице-Сергиеву, Киево-Печерскую и Почаевскую лавры, Оптину пустынь, Саввин Сторожевский монастырь, Тихонову пустынь, Соловецкий, Саровский, Новоиерусалимский монастыри, Сергиев скит, Зосимову пустынь, обители, расположенные возле Санкт-Петербурга, а также другие древние монастыри. Елизавета Фёдоровна участвовала в праздниках прославления Божьих угодников, таких как Серафим Саровский, священномученик Ермоген, и в торжествах, связанных с вторичным обретением мощей княгини Анны Кашинской. В письме Николаю II она назвала дни, проведённые в 1909 г. в Кашине, «идеальным повторением Сарова». Елизавета Фёдоровна постигала смысл «духовного учительства» через паломничество и в процессе чтения житийной и святоотеческой литературы, а также в беседах со схиархимандритом Гавриилом (Зыряновым), священниками Алексием и Германом Зосимовскими, схиигуменьей Фамарью (Марджановой), оптинскими старцами иеромонахами преподобными Нектарием (Тихоновым) и Анатолием (Потаповым). Паломничество Елизаветы Фёдоровны в монастыри Урала было прервано Первой мировой войной. В Москве она организовала Комитет по оказанию благотворительной помощи семьям лиц, призванных на войну. В Марфо-Мариинской обители был открыт госпиталь. В дни войны Елизавета Фёдоровна возглавляла десятки учреждений в качестве попечителя либо председателя. 29 июля 1914 г. на заседании комитета, состоявшемся в её доме в Марфо-Мариинской обители, было принято решение об открытии постоянного координирующего органа (канцелярии комитета) и о начале приёма денежных и вещевых пожертвований, а также об учреждении «Еженедельника», в котором будут освещаться все эти вопросы. Одна из главных задач комитета состояла в обеспечении работой жён солдат, призванных на войну. Под мастерские были отданы дома генерал-губернатора, Российского благородного собрания и Старогостиный двор. Семьям воинов также оказывалась сельскохозяйственная помощь, дети лиц, призванных на войну, обеспечивались всем необходимым. 27 сентября 1914 г. комитет великой княгини принял решение об открытии ряда учреждений для сирот. По призыву Елизаветы Фёдоровны артисты и художники России проводили благотворительную работу в пользу воинов и их семей. Своеобразной помощью фронту было издание открыток-репродукций картин великих русских художников (например, репродукция картины М.В. Нестерова «Милосердие») и рисунков Елизаветы Фёдоровны, календарей и т.д. Елизавета Фёдоровна отправила воинам русской армии несколько составов с рождественскими подарками.