В 1930 гг. в Еврейской автономной области основывались только еврейские поселения. К 1 декабря 2007 г. в области существовало 39 зарегистрированных религиозных организаций. Наиболее значительным религиозным объединением в области является Биробиджанская и Кульдурская епархия Русской православная церкви, образованная 7 октября 2002 г. в границах Еврейской автономной области (правящий архиерей – епископ Иосиф (Балабанов), кафедральный собор – в честь Благовещения Пресвятой Богородицы в Биробиджане – первый за всю историю региона каменный храм, освящён 21 сентября 2005 г.). Раньше данная территория составляла Биробиджанское благочиние Хабаровской епархии. К началу 1920 гг. на территории Еврейской автономной области действовали 24 православных храма и походные церкви и 20 часовен, все они были уничтожены к 1936 г. Возрождение православной церковной жизни в регионе началось в 1990 гг. В марте 1992 г. в Биробиджане был зарегистрирован приход во имя апостола Иакова, в 1994 г. – приход во имя великомученика Пантелеимона. Первым построенным в Еврейской автономной области храмом стала деревянная церковь во имя Николая Чудотворца, освящённая в 1999 г. В 2001 г. в центре Биробиджана в сквере Победы по инициативе воинов-интернационалистов была возведена часовня в честь Державной иконы Божьей Матери в память о воинах, павших за Отечество. В Биробиджанской епархии идёт активное храмовое строительство. К концу 2007 г. в составе епархии было 28 приходов (зарегистрировано 19), в том числе приход РПЦЗ, пять храмов, 22 молитвенных дома, часовня, женский монастырь Московского митрополита Иннокентия в селе Раздольном Биробиджанского района (монастырь образован 21 августа 2007 г.). В епархии совершают служение 14 священников и пять дьяконов. В 2004 г. при Биробиджанском епархиальном управлении начали работу двухгодичные пастырско-богословские курсы, в епархии открыто шесть воскресных школ. При созданном в 2007 г. епархиальном социально-просветительном центре действует православный военно-патриотический кадетский класс, в котором обучаются 30 мальчиков, открыта общедоступная библиотека православной литературы. С 2003 г. на областном телевидении выходит еженедельная православная телепередача «Лествица», с 2004 г. издаётся ежемесячная епархиальная газета «Благовест». Большое внимание епархия уделяет социальному служению. С 1995 г. работает православная больница при приходе во имя великомученика Пантелеимона в Биробиджане. При больнице действуют организованный в 2005 г. центр психологической реабилитации и социально-психологической помощи населению, благотворительная столовая для неимущих. Во многих приходах области открыты благотворительные столовые, проводятся сбор и распределение одежды для малообеспеченных людей.