Евфимий написал к сборнику предисловие (в полемическом тоне), в котором упоминает каких-то идейных противников, оглавление, а также выходную запись, в которой отмечено, что это «писмо самого архиепископа Феодосия бывшаго Великаго Новаграда и Пъскова, последнее руки его благословение, во мнозех болезнех и трудех изнеможе докончати, повеле мне, грешному рабу и ученику своему, последнему чернецу Еуфимию, сие послание духовное дописати духовною любовью» (Российская национальная библиотека). В статьях кодекса затрагиваются проблемы земельной, торговой, таможенной политики, местничества, вотчинного и поместного землевладения, новых слобод, необходимость ведения писцовых книг, меры надзора за ногайскими купцами и послами, вопросы о корчмах и мыте и др. В келье архиепископа Феодосия также был составлен сборник (Исторический музей), содержащий на листах 95–164 материалы из архива Максима Грека, в том числе его перевод «Краткой повести» о падении Константинополя Энеа Сильвио Пикколомини (впоследствии папа Пий II). Эти материалы не были волоколамского происхождения. В сборнике рукой Евфимия переписаны тексты, им же сделаны приписки и исправления. С указанными выше рукописями связан принадлежавший Евфимию кодекс Российской государственной библиотеки, в котором есть почерк Евфимия, а также почерк архиепископа Феодосия. Сборник содержит отредактированные Евфимием произведения, посвящённые Иосифу Волоцкому, в частности, надгробное Слово преподобного Досифея (Топоркова). По мнению Николая Петровича Попова, в конце 1570 гг. Евфимий переработал вторую редакцию минейного Жития преподобного Иосифа, а затем написал новое Житие святого, известное исследователям по списку Российской государственной библиотеки. Однако эта точка зрения в историографии разделяется не всеми. В 1563 г. по благословению своего учителя Евфимий переписал Часослов (Исторический музей). «Исполненный задушевной скорби» рассказ Евфимия о последних днях архиепископа Феодосия в автографе автора, как установил Василий Осипович Ключевский, сохранился в сборнике Российской государственной библиотеки. По жанру он представляет собой Житие архиепископа Феодосия. В этом же кодексе содержится заметка Евфимия о взятии русскими войсками Полоцка в феврале 1563 г. К 1569 г. относится написанный книжником некролог монаху Феодосию (Плещееву). В 1560 гг. Евфимий стал уставщиком Волоколамского монастыря, в начале 1570 гг., как полагают исследователи, исполнял также обязанности казначея (в этой должности он упоминается в «изустной памяти» Евфимию Ивана Бровцына 1571/1572 г. – Акты феодального землевладения и хозяйства).