Третье обновление Софийского собора в Вологде и устройство новой ризницы было осуществлено на частные пожертвования (около 30 тыс. руб.), поступившие из разных епархий в ответ на воззвания Евлампия в 1847 и 1848 гг. В год празднования 700-летия Вологды был создан комитет (15 ноября 1847 г.), занимавшийся этими проектами, 9 мая 1848 г. приступили к их выполнению. За три года была отреставрирована вся стенная живопись с точным воспроизведением особенностей древнего рисунка, возобновлены резьба, позолота и окраска всех иконостасов, вычищены и отчасти поновлены иконы, во всём соборе заменили на новый чугунный пол и проч. Евлампий наблюдал за ходом работ, нередко видели, как он взбирался «по зыблющимся подмосткам к самым сводам храма, на 18-саженную вышину». 15 августа 1851 г. состоялось освящение собора. В июне-июле 1848 г. Евлампий устраивал крестные ходы во избавление города от достигшей Вологды эпидемии холеры и составил их описание. 21 ноября 1848 г. освятил обновлённую и расширенную Кирилло-Богословскую церковь при Вологодской духовной семинарии. Жалобы Евлампия в Синод на ректора семинарии архимандрита Адриана (Тяжелова) и на плохое состояние учебного заведения привели в 1848 г. к ревизии духовной семинарии протоиереем Петром Делицыным и к увольнению ректора. В 1851 г. во исполнение указа Синода Евлампий учредил Комитет для составления церковно-исторического и статистического описания Вологодской епархии, для которого разработал подробные правила, предварительно просмотрев все материалы, поступавшие в комитет. Заботился об открытии в епархии единоверческих церквей. 13 июня 1852 г. Евлампий был переведён на Тобольскую и Сибирскую кафедру с возведением в сан архиепископа. 15 августа прибыл в Тобольск, в тот же день совершил первое богослужение в Софийском кафедральном соборе. За время пребывания Евлампия в епархии было построено около 30 приходских храмов, открыты богадельни для вдов и сирот духовного звания. Каменный настоятельский корпус Междугорского во имя святого Иоанна Предтечи монастыря, сгоревший в декабре 1852 г., был заново отстроен благодаря деятельному участию Евлампия, открывшему подписку для сбора пожертвований по всей епархии. Пострадавшая при этом пожаре Почаевская церковь была отремонтирована и освящена Евлампием в честь Введения во храм Пресвятой Богородицы. Евлампий ходатайствовал перед Синодом о преобразовании монастыря в женский, т.к. в епархии не было женских обителей, перевод состоялся в 1864 г., уже после его смерти. В 1856 г. для чтимой в епархии Абалакской иконы Божьей Матери в Москве была изготовлена новая «однозолотая же риза отличной работы и рисунка».