За время инспекторства и ректорства Доната из духовной семинарии за плохую успеваемость или поведение не был уволен ни один семинарист. По его инициативе 21 октября 1863 г. было открыто Архангельское женское епархиальное училище, с 15 апреля 1865 г. по 1 июля 1870 г. был старшим членом совета этого училища. В 1865 г. содействовал открытию Ломоносовской приходской школы в Архангельске, приуроченному к 100-летию со дня смерти Михаила Васильевича Ломоносова. 4 сентября 1858 г. назначен членом Архангельской духовной консистории, главной сферой его деятельности была борьба со старообрядчеством. 20 сентября 1860 г. стал членом строительного комитета по перестройке одного из зданий при архиерейском доме для размещения там консистории. Впоследствии ещё несколько раз состоял членом строительных комитетов (в частности, с 7 ноября по 31 декабря 1862 г. – комитета по исправлению зданий Архангельской духовной семинарии). С 14 июля 1861 г. по 1 мая 1879 г. был членом губернского статистического комитета. С 18 ноября 1866 г. по 1 июля 1870 г. – благочинный Троицкого кафедрального собора в Архангельске, Архангельского и холмогорского Успенского женского монастырей. С 19 мая 1858 г. Донат был старшим членом попечительства о бедных духовного звания Архангельской епархии. С 18 марта по 31 декабря 1863 г. входил в состав епархиального комитета по улучшению быта православного белого духовенства. 28 июля 1865 г. назначен членом одноимённого губернского комитета, в котором трудился до закрытия в 1871 г. В 1873 г. пожертвовал собственные средства в пользу пострадавших от неурожая лиц духовного звания. В 1879 г. вызван в Санкт-Петербург на чреду священнослужения. 31 марта 1879 г. указом Святейшего Синода Донат был хиротонисан во епископа Брестского, викария Литовской епархии. Хиротонию 27 мая того же года в Александро-Невской лавре возглавил Новгородский и Санкт-Петербургский митрополит Исидор (Никольский), который постоянно поддерживал общение с Донатом, помогал ему советами. В Гродно по инициативе Доната было открыто православное братство. Вскоре Донат стал известен и за пределами епархии благодаря обличительной проповеди на текст «Людие Мои, что сотворих вам?» по поводу убийства императора Александра II, произнесённой 2 марта 1881 г. перед панихидой в Софийском кафедральном соборе в Гродно. Проповедь была помещена в «Гродненских губернских ведомостях», перепечатана в крупнейших российских газетах и журналах, переведена на французский и польский языки, издана отдельно тиражом несколько тыс. экз. для раздачи по церквам (также опубликована во втором выпуске «Поучений...» Доната). 14 мая 1881 г. Донат был назначен епископом Ковенским, викарием Литовской епархии, и управляющим Пожайского в честь Успения Пресвятой Богородицы монастыря, где и жил. Затем переехал в Вильну. Из-за болезни Литовского архиепископа Александра (Добрынина) фактически осуществлял управление епархией. В Литве боролся с попытками католического духовенства обращать православную паству в свою веру.