В 13 титулах «Дигест» есть сочинения, не вошедшие в предыдущие массы (исследователи полагают, что комиссия получила их после начала работы). Эти сочинения принято относить к четвёртой массе (так называемые appendix – около 122 книг Лабеона, Сцеволы, Венулея). По мнению Ф. Блуме, возможно, эту группу разбирали те, кто работали с массой Папиниана. Такой взгляд на организацию работы подтверждается структурой большинства титулов (SEPA – по начальным буквам масс Sabinus, edictum, Papinianus и appendix). В некоторых титулах есть смещение данного порядка, в связи с чем гипотеза Ф. Блуме подвергается сомнениям (Д. Ослер). Исследователи предполагают, что после сбора материала в указанные массы компиляторы должны были разделиться на три рабочие группы – по числу выделенных масс (appendix отнесён к массе Папиниана). В противном случае им вряд ли удалось бы обработать достаточное количество литературы, чтобы уложиться в срок. Первые полтора года каждая из групп должна была заниматься непосредственно чтением произведений, отбором необходимых фрагментов и их упорядочением по титулам. При этом устранялись выявленные повторы и противоречия. В оставшиеся полтора года три рабочие группы, очевидно, вновь составили общую комиссию, которая объединила полученный материал в титулы и в книги, ещё раз отслеживая и устраняя повторы и противоречия, при необходимости получая одобрение императора. В тот же период было изготовлено необходимое число копий «Дигест» Юстиниана. Их огромный объём даёт повод некоторым исследователям утверждать, что компиляторы использовали некий готовый порядок фрагментов (P. Эренцвейг) или составленный ранее обобщающий материал (например, расширенные комментарии Ульпиана к Сабину), могли не полностью читать оригинальные сочинения или вовсе основывались на неизвестном теперь частном сборнике сочинений юристов, на своего рода «протодигестах». Однако эти гипотезы в целом не признаны научной традицией. В то же время трудно исследователям представить, чтобы компиляторы начали работу с чистого листа, хотя небольшие частные сборники IV–V вв. заметно уступают «Дигестам» Юстиниана по объёму. Исследователи не исключают, что члены комиссии неоднократно прибегали к помощи технического персонала, который выполнял их указания по копированию необходимых фрагментов из сочинений в титулы нового сборника. Они полагают, что входившие в комиссию адвокаты при объединении всех масс вновь исправили в тексте устаревшие нормы и термины «древнего права». Сохранившиеся повторы и противоречия в тексте «Дигест», отсутствие ясного порядка в расположении фрагментов внутри титула, участившееся нарушение последовательности масс в последних десяти книгах указывают на поспешность в работе компиляторов. Подлинная рукопись «Дигест» (официальный текст), составленная, как полагают исследователи, для императора и утверждённая им в декабре 533 г., утрачена. «Дигесты» сохранились в нескольких рукописях, между которыми есть расхождения. Наиболее древняя и надёжная рукопись была создана в Риме около 600 г. греческими писцами, заново была обнаружена около 1075 г. в Амальфи (Южная Италия), затем перевезена в Пизу, откуда в 1406 г. при захвате города флорентийцами вывезена во Флоренцию. Хранится в библиотеке Лауренциана без специального шифра (репринтное издание: Iustiniani Augusti digestorum seu pandectarum Codex Florentinus olim Pisanus phototypice expressus. R., 1902–1910 гг.). В литературе называется «Littera Pisana» или «Littera Florentina».