Во внутренней политике стремился сдерживать рост могущества провинциальной знати, в частности, противился назначению графов из числа местных землевладельцев, что было узаконено эдиктом короля Хлотаря II (614 г.), поскольку вело к узурпации земель королевского домена. Не нарушая эдикта 614 г., старался назначать на графские должности своих придворных или бывших придворных отца. Такую же политику проводил в отношении церкви, что шло вразрез с постановлениями Собора в Клиппиаке (625/626 г.), где указывалось, что епископ мог назначать на вакантные кафедры только из числа местных клириков. Для восполнения финансовых потерь, понесённых в годы войн, Дагоберт I в середине 630 гг. провёл частичную секуляризацию церковных земель, а также земель некоторых крупных светских землевладельцев. Эти меры стали причиной негативного отношения к королю, которое нашло отражение в «Хронике Фредегара». Хронист обвинял Дагоберта I в том, что тот забыл о справедливости, которую прежде любил, поддавшись собственной жадности, посягнул на имущество церкви и своих дружинников. Проведённая Дагобертом I секуляризация церковного имущества в целом не отменяла покровительственного отношения к церкви. Король дарил церквам дорогую утварь, а также щедро украшал их. Особо благоволил Дагоберт I к церкви св. Дионисия в Катуллиаке. Основанная около середины V в. по инициативе св. Геновефы базилика при Дагоберте I стала центром паломничества. Была перестроена гробница святого, богато украшены интерьер и фасад церкви. Королевский ювелир Элигий изготовил драгоценные раки для мощей св. Дионисия и его спутников мучеников Рустика и Елевферия. Дагоберт I пожаловал общине клириков церкви св. Дионисия земли в разных частях королевства, в том числе в Провинции. В 634/635 г. Дагоберт I разрешил клирикам церкви св. Дионисия проводить поблизости ежегодную ярмарку, причём все пошлины от торговых операций шли не в королевскую казну, а в пользу церкви. Дагоберт I стал первым королём франков, который был похоронен в базилике св. Дионисия, впоследствии усыпальнице королей Франции. Находясь на королевской вилле недалеко от Паризиев, Дагоберт I простудился, почувствовал себя плохо и приказал перевезти его к церкви св. Дионисия, куда повелел явиться и майордому Австразии Эгану, заботам которого он поручил малолетнего Хлодвига II и его мать Нантхильду. Дагоберт I скончался на 16-м году правления. Впоследствии монахи монастыря Сен-Дени сделали многое для прославления своего покровителя, создав идеальный образ «доброго короля». Некоторые средневековые хронисты называли Дагоберта I святым, хотя он никогда не был официально канонизирован. Титул святого был ошибочно перенесён на Дагоберта I с его внука Дагоберта II (ум. в 679 г.), спутника св. Вильфрида Йоркского. Дагоберт I был последним королём из рода Меровингов, который обладал реальной властью. Хотя формально он был королём всех франков не больше года, в период между смертью Хариберта II и провозглашением Сигиберта королём Австразии, тем не менее, в 630 гг. он держал под контролем все провинции Франкского королевства. Уже при его преемниках, прозванных «ленивыми королями», власть переходит в руки майордомов. На протяжении Средневековья «добрый король» Дагоберт I оставался одним из самых популярных франкских правителей, героем легенд, сказаний и героических поэм (chançons de gestes).