После упразднения Троицкого Данилова монастыря в начале 1923 г. рака с мощами Даниила была перенесена в краеведческий музей. В 1923–1926 гг. она была выставлена в упразднённом и переданном музею Горицком монастыре в отделе церковных древностей, в 1960–1970 гг. экспонировалась в дореволюционно-историческом отделе, с начала 1978 г. хранилась в фондах музея. 20 апреля 1994 г. рака с мощами Даниила была передана Никольскому женскому монастырю, в 1996 г. вернулась в возобновлённый Троицкий Данилов монастырь, где и находится в настоящее время на прежнем месте. В грамоте архимандрита Троицкого Данилова монастыря Тихона патриарху Никону 1652 г. говорится: «А образ его, чудотворцов, написан изстари, и канон, и тропарь, и житие, и стихеры», однако в Трефологионе, изданном в Москве в 1638 г., служба Даниилу отсутствует. В 1780 г. новую службу составил настоятель монастыря архимандрит Иосиф (Быков). Акафист святому был написан смотрителем Переславль-Залесского духовного училища священником Александром Ивановичем Свирелиным (1830–1906 гг.). Имя Даниила включено в Собор Ростово-Ярославских святых, празднование которому было установлено 10 марта 1964 г. по инициативе Ярославского и Ростовского архиепископа Никодима (Ротова). Иконография Даниила принадлежит к числу наиболее почитаемых в Переславле-Залесском святых, но его изображений сохранилось немного. Хотя уже в 1540 гг. он был местно прославлен как чудотворец, а в 1550–1560 гг. составлено его Житие, о существовании икон преподобного этого периода в настоящее время ничего не известно. Самые ранние изображения Даниила связаны с открытием его мощей и установлением в 1653 г. официального местного празднования. Покров на раку Даниила с шитым образом преподобного датируется по летописи на его кайме (1658–1659 гг.). Его облик достаточно условен, индивидуальные особенности практически отсутствуют. Даниил представлен фронтально в рост, с благословляющей десницей и свитком в левой руке, облачён в монашескую мантию, имеет тонкие черты лица, узкую, раздвоенную на конце бороду. Колорит произведения выдержан в коричнево-синей гамме, шитьё выполнено шёлком «в раскол» и прядеными металлическими нитями (нимб). Ростовой образ Даниила помещён в росписи Троицкого собора Данилова монастыря в Переславле-Залесском, выполненной в 1668 г. артелью костромского мастера Гурия Никитина. Даниил изображён в нижнем ряду северо-западного столпа, на трёх других гранях которого представлены преподобные Никита Переславский, Иоанн Лествичник, Симеон Столпник. Даниил одет в коричнево-вишнёвую мантию, охристую рясу, подпоясанную жёлтым поясом с вишнёвым орнаментом, зеленовато-синий параман, в левой руке – развёрнутый свиток. Данная иконография, но со свёрнутым свитком использована на иконе конца XX – начала XXI в., выполненной в мастерской Троице-Сергиевой лавры, из местного ряда нового иконостаса придельного храма во имя Даниила в Даниловом монастыре. Его образ находится в картуше заставки на странице с записью рода преподобного в синодике Данилова монастыря 1672 г.