Согласно книгам 1627–1628 гг. Московского уезда, в вотчину Давидовой пустыни входили село Легчищево на реке Родинке с восемью деревнями по реке Лопасне, 11 пустошей с 55 крестьянскими дворами, к середине XVII в. – восемь деревень и десять пустошей с 62 дворами. С 1657 г. на реке Лопасне стояла монастырская мельница с двором. В 1646–1715 гг. упоминается двор «для осадного времени» в Серпухове. С 1664 г. Давидова пустынь имела подворье при Георгиевской церкви в Москве, на ул. Ордынке, а также с 7 июля 1689 г. – часовню в Москве, у Арбатских ворот. К 1678 г. за Давидовой пустынью в Московском уезде числилось 83 двора с 613 крестьянами, в 1700 г. – 95 дворов. К началу XVIII в. вотчинные владения Давидовой пустыни находились в различных местах: в Серпухове, Малинской волости Коломенского уезда, Хатунской и Замыцкой волостях Московского уезда. В связи с секуляризационными реформами начала XVIII в. все доходы от владений Давидовой пустыни стали поступать в Монастырский приказ, позднее – в Коллегию экономии. Часть этих доходов выплачивалась братии: при игумене Пахомии (1754–1760 гг.) игумену – 6 руб., иеромонахам и иеродиаконам – по 3 руб., монахам – по 2 руб., псаломщику и пономарю – по 1 руб. 8 коп.; в 1764 г. игумену – 16 руб., пяти иеромонахам – по 8 руб., иеродиакону – 6 руб., двум монахам  по 3 руб., псаломщику – 2 руб. (в год). В 1764 г. Давидова пустынь была лишена деревень и пустошей и оставлена на своём содержании. Указом консистории от 17 марта 1765 г. к обители приписана часовня в Москве, у Москворецкого моста, где хранился древний почитаемый образ Всемилостивого Спаса. За молебны и от продажи свечей в часовне собиралось 127–130 руб. в год. До 1891 г. Давидовой пустыни также была приписана часовня у Калужской заставы. В 1860 г. Давидова пустынь была наделена 130 десятинами леса близ современной станции Сходня. Капитал Давидовой пустыни в 1908–1911 гг. составлял 175 102 руб. в 1915–1916 гг. – 227 424 руб. Первоначально все строения Давидовой пустыни были деревянными. В 1600 г. на келейные деньги игумена Леонида была построена деревянная Вознесенская церковь (впоследствии перенесена в село Легчищево). В 1619 г. Давидова пустынь была разорена литовцами и черкасами гетмана П.К. Сагайдачного. По описи 1627–1628 гг., в Давидовой пустыни значится деревянная Вознесенская церковь с приделом Николая Чудотворца с трапезной. К 1657 г. в Давидовой пустыни находились: обветшавший деревянный шатровый «о трёх верхах» Вознесенский храм с приделами Успения и Николая Чудотворца, недостроенный каменный Вознесенский храм, Знаменская часовня над гробом преподобного Давида, деревянная колокольня с пятью колоколами, хозяйственные постройки, ограда.