19 мая Антонин, поддерживаемый Е.А. Тучковым, встал во главе самочинного обновленческого Высшего церковного управления (ВЦУ), тем самым придав расколу окончательное оформление. При этом Антонин неизменно находился в оппозиции к В.Д. Красницкому и возглавляемой им группе белого духовенства «Живая церковь» (ЖЦ), игравшей в июне 1922 г. – апреле 1923 г. ведущую роль в обновленческом расколе. 6 августа 1922 г. Антонин был назначен ВЦУ на Московскую кафедру с титулом «архиепископ Крутицкий», 20 августа принял титул «митрополит Московский и всея России». 6–17 августа 1922 г. в Москве состоялся Всероссийский съезд «Живой церкви» (ЖЦ), на котором произошёл разрыв между сторонниками В.Д. Красницкого и группой Антонина, не вернувшегося на съезд после первого заседания. Считая «Живую церковь» (ЖЦ) «поповским профсоюзом, желающим только жён, наград и денег», Антонин выступал против второбрачия духовенства, не поддержал идеи закрытия всех монастырей и упразднения епископата. 24 августа того же года Антонин встал во главе «Союза церковного возрождения» (СЦВ) – обновленческой группировки, которая стремилась в отличие от сословно-клерикальной «Живой церкви» (ЖЦ) найти опору в мирянах. В Положении «Союза церковного возрождения» (СЦВ) так определялась его задача: «Союз отвергает кастовое крепостничество и кастовое утверждение интересов «белого попа». Союз стремится к улучшению церковных порядков по девизу: всё для народа и ничего для сословия, всё для Церкви и ничего для касты». 22 сентября 1922 г. Антонин заявил о своём разрыве с живоцерковниками и выходе из ВЦУ, 23 сентября постановлением ВЦУ был освобождён от всех должностей. В.Д. Красницкий обратился в ГПУ с просьбой выслать Антонина из Москвы, т.к. «он становится знаменем контрреволюции». В ответном письме В.Д. Красницкому указывалось, что «органы власти... не имеют ничего против Антонина Грановского и нисколько не возражают против организации нового, второго ВЦУ». В отличие от ГПУ правительство России в это время стремилось предотвратить раскол в обновленчестве. О необходимости преодоления разногласий между группами Антонина и В.Д. Красницкого говорилось в справке ВЦИК, подготовленной к заседанию его президиума в конце сентября 1922 г. В результате между основными обновленческими течениями был достигнут временный компромисс. В октябре 1922 г. Антонин вернулся на пост председателя ВЦУ, после того как оно было реорганизовано на коалиционных началах, включив в себя представителей «Живой церкви» (ЖЦ), «Союза церковного возрождения» (СЦВ) и новообразованной группировки «Союз общин древлеправославной церкви» (СОДАЦ), который возглавил А.И. Введенский. На обновленческом «Втором поместном соборе Православной Российской Церкви» (Москва, 29 апреля – 9 мая 1923 г.)