В 1870 г. при Архангельском духовном училище был открыт подготовительный класс, в том же году введено преподавание карельского и зырянского языков. В 1837 г. в уездных училищах обучались 108 учеников, в 1850 г. – 101, в 1912 г. – 213. В 1882–1885 гг. епископом Серапионом (Маевским) был открыт причётнический класс (закрыт около 1890 г.). При Михаило-Архангельском монастыре в 1893–1906 гг. существовала двуклассная псаломщическо-училищная школа, содержавшаяся на средства епархии. 2 октября 1863 г. было открыто епархиальное женское училище для девушек из духовного сословия (в 1863–1869 гг. – четырёхклассное с четырёхлетним курсом обучения). Преподавание общеобразовательных предметов велось по сокращённой программе, основное внимание уделялось занятиям рукоделием и обучению практическим навыкам преподавания. С 1869 г., согласно Уставу о епархиальных духовных женских училищах 1868 г., оно было преобразовано в трёхклассное с шестилетним курсом, в 1881 г. – в шестиклассное, в 1909 г. – в семиклассное. В ноябре 1894 г. при училище была открыта образцовая церковноприходская школа. С 1869 г. окончившие полный курс получали право на преподавание в качестве домашних учительниц. Число воспитанниц: в 1863 г. – 28, в 1899 г.  – 265, в 1912 г. – 315. Училище содержалось на средства епархии. В середине 1830 гг. в епархии были созданы первые церковноприходские школы, их число особенно возросло после издания в 1884 г. «Правил о церковноприходских школах». В 1867 г. в епархии существовало 130 церковных школ, в 1880 г. – 12, в 1902 г.  – 283, в 1913 г. – 256 (из них: 4 двуклассные, 251 одноклассная и школа грамоты). С 1896 г. в епархии создавались второклассные училищные школы, готовившие, в основном, преподавателей для школ грамоты (в 1913 г. в епархии действовали три училищные школы). Первоначально церковные школы содержались на средства епархии, с 1892 г. на их содержание выделялось пособие из казны. В 1893–1908 гг. почётным попечителем церковных школ епархии являлся Иоанн Кронштадтский (всего им было собрано и пожертвовано около 150 тыс. руб.), некоторые школы носили его имя (в частности, в селе Сура). Первоначально в большинстве церковноприходских школ преподавало местное духовенство, с конца 1890 гг. увеличилось число светских преподавателей (в основном, выпускниц епархиального женского училища). В 1909 г. при церковноприходских школах епархии существовали 244 библиотеки, в ряде школ было организовано обучение ремёслам. Духовные учебные заведения находились в ведении епархиального училищного совета (учреждён в 1884 г.), во главе которого стоял ректор Архангельской духовной семинарии. К началу XX в. училищный совет имел пять уездных отделений, или наблюдательных округов (в 1888 г. – 9), во главе с уездными наблюдателями. В 1895 г. учреждена должность епархиального наблюдателя церковноприходских школ. Начало миссионерской деятельности среди ненцев (самоедов) относится к 1730 гг., после издания манифеста императрицы Анны Иоанновны от 17 марта 1730 г. об усилении миссионерской деятельности среди староверов и инородцев-язычников. В 1784 г. епископ Вениамин (Краснопевков-Румовский) определил несколько ненцев для обучения в семинарию с целью последующего рукоположения.