На Чукотке Амфилохий пробыл с 1 июня 1909 г. по август 1910 г.; проповедовал среди местного населения и основал церковноприходскую школу на 20 учащихся. За 11 лет служения на Аляске и Чукотке крестил до 1,5 тыс. язычников. В апреле 1912 г. согласно указу архиепископа Алеутского и Североамериканского Платона (Рождественского) Амфилохий стал благочинным приходов Канады и настоятелем прихода в городе Эдмонтон (провинция Альберта) с проживанием в приписном к нему приходе в посёлке Раббит-Хилл. 6 мая 1914 г. возведён в сан архимандрита. 20 апреля 1915 г. епископом Аляскинским Александром (Немоловским) был назначен настоятелем кафедрального Свято-Архангело-Михайловского собора в Ситке и благочинным Аляскинских миссий, 10 сентября 1916 г. епископом Аляскинским Филиппом (Ставицким) – членом Аляскинского духовного правления. После отъезда Амфилохия в Канаду православная паства, оставшаяся в Северной Аляске без пастырского руководства, попала под влияние нахлынувших туда инославных миссионеров, главным образом, пресвитериан и методистов. Из более чем 3 тыс. православных к 1916 г. в православии оставалась едва ли треть. Для противодействия инославному влиянию и прозелитизму Амфилохий по собственному прошению и с благословения архиепископа Алеутского и Североамериканского Евдокима (Мещерского) с июня 1916 г. перевели на Северную Аляску начальником Североаляскинских миссий. Осенью того же года он поселился в стане начальника Куикпакской миссии на реке Юкон, при Крестовоздвиженской церкви, и вскоре были возобновлены занятия в школе катехизаторов, открылся приют для детей-сирот. В 1923 г. Амфилохий был избран викарным епископом Аляскинским в помощь Североамериканскому митрополиту Платону. Для совершения над ним наречения и архиерейской хиротонии Амфилохий был направлен епархиальным начальством в Москву, к патриарху Тихону, однако по обстоятельствам того времени не смог проехать дальше Риги. Его наречение во епископа состоялось по благословению патриарха 28 июня 1924 г. после возвращении Амфилохия из Европы. 28 июля того же года митрополит всей Америки и Канады Платон (Рождественский), епископ Чикагский Феофил (Пашковский) и епископ Детройтский Аполлинарий (Кошевой) в кафедральном Свято-Николаевском соборе Нью-Йорка хиротонисали Амфилохия во епископа. Он занимал Аляскинскую кафедру до сентября 1931 г. По болезни был вынужден уйти на покой в монастырь Тихона Задонского в Саут-Кейнане (штат Пенсильвания). Скончался от воспаления лёгких, погребён на кладбище монастыря в часовне-усыпальнице. Амфилохий – автор ряда этнографических заметок о Куикпакской миссии и жизни православной церкви на Аляске, в том числе походных журналов, частично опубликованных в «Американском православном вестнике», частично хранящихся в архиве православной церкви в Америке.