В 1912 г. начал строительство нового комплекса зданий подворья на участке, соседствовавшем с усадьбой на Полянке, который был раньше приобретён для Пантелеимонова монастыря тульским купцом Иваном Ивановичем Сушкиным, братом схиархимандрита Макария. Комплекс включал в себя главное каменное трёхэтажное здание (д. 3 по первому Петропавловскому пер.), в полуподвале которого разместились трапезная и братские кельи, на первом этаже – книжная лавка и Николаевский приют, на втором этаже – кельи, на третьем – кельи и домовая церковь в честь иконы Божьей Матери «Скоропослушница» (освящена 30 сентября 1918 г. Патриархом Московским и всея России Тихоном), а также трёхэтажное здание, служившее складом для книг, издаваемых монастырём, и другие хозяйственные постройки. Главным в деятельности Аристоклия Афонского в этот период стало старчество. Несмотря на тяжёлый недуг (бо́льшую часть жизни он страдал водянкой и болезнью ног), Аристоклий Афонский духовно окормлял множество людей, иногда принимая в день более тысячи человек. Особо почитали старца святитель Тихон и епископ Трифон (Туркестанов). Аристоклий Афонский прославился дарами прозорливости (предвидел Октябрьскую революцию 1917 г. и Великую Отечественную войну), исцеления, изгнания бесов. В тяжёлое революционное время по его молитвам люди спасались от голодной смерти, выходили из тюрьмы, избегали расстрела. Благодаря Аристоклию Афонскому многие неверующие обратились к Богу. Он был погребён в усыпальнице, устроенной под храмом в подвале главного дома Афонского подворья; старца отпевали епископ Трифон, епископ Арсений (Жадановский) и Можайский архиепископ Иоасаф (Каллистов), викарий Московской епархии. В ноябре 1922 г. домовый храм Афонского подворья и усыпальница были ликвидированы, на подворье разместилось общежитие студентов Горной академии. В 1923 г. духовные дети Аристоклия Афонского и братия перезахоронили его останки на Даниловском кладбище, близ Никольской часовни, как предсказал старец (по свидетельству очевидцев, тело его было нетленно). Летом 2004 г. на Даниловском кладбище были обретены мощи Аристоклия Афонского. 6 сентября 2004 года старец Аристоклий был прославлен в лике местночтимых святых Москвы и Московской епархии. На Божественной литургии, совершённой Патриархом Московским и всея Руси Алексием II в Успенском соборе Кремля в сослужении митрополита Калужского и Боровского Климента, архиепископов Истринского Арсения, Владимирского Евлогия, Орехово-Зуевского Алексия, епископа Дмитровского Александра, московский старец был причислен к лику преподобных. За патриаршим богослужением было оглашено «Определение о канонизации в лике местночтимых святых преподобного Аристоклия (Амвросиева), старца Московского (1846–1918)». 13 ноября 2004 г. мощи Аристоклия были перенесены крестным ходом из Свято-Данилова монастыря в храм великомученика Никиты на Афонском подворье Москвы.