Слушатели курсов проводили миссионерские беседы, по праздникам и воскресным дням учились произносить в храмах проповеди, которые затем разбирались на лекциях. Андроник считал пагубным равнодушие многих архиереев Русской церкви к проблемам современной общественной жизни, высказывал императору Николаю II своё негативное отношение к некоторым сторонам государственной политики, резко отрицательно относился к Григорию Ефимовичу Распутину, который его боялся. В годы Первой мировой войны Андроник принимал деятельное участие в помощи воинам, посещал раненых, поступавших с октября 1915 г. в пермский лазарет; предписал ввести во всех монастырях Пермской епархии «неусыпаемое круглосуточное чтение акафистов Господу, Божией Матери и святым»; благословил после прочтения акафиста прочитывать молитву о даровании победы и молитву об упокоении воинов; благословил всем женским монастырям епархии выделить по два человека для сбора пожертвований по сёлам и деревням на нужды воинов, на содержание лазаретов и на пасхальные подарки. После Февральской революции 1917 г. (в марте) Пермский исполнительный комитет послал телеграмму обер-прокурору Святейшего Синода с требованием уволить Андроника от управления епархией «как опасного для общественной безопасности и как препятствующего духовенству в его праве соорганизоваться». Узнав об этом, Андроник отправил обер-прокурору протест. Московскому митрополиту Тихону он писал: «Чем ближе присматриваюсь к растущей подлости, тем больше решаюсь отрясти прах от ног и уйти на покой». Вскоре начал работу Поместный Собор РПЦ 1917–1918 гг., и Андроник уехал в Москву. На Соборе был избран Священный Синод из шести членов, на случай смерти членов Синода было избрано шесть заместителей, среди них – Андроник. Вошёл в состав Издательского отдела Собора и был одним из энергичных его деятелей (участники Собора называли его «Огнь пылающий»). После Октябрьской революции 1917 г. Андроник обеспечивал выход в свет документов и посланий Собора; в декабре 1917 г. побывал в Перми. Начавшиеся в епархии гонения на церковь заставили его обратиться к пастве с воззванием, в котором Андроник призывал встать на защиту церкви; воззвание просил читать не только в храмах, но и при всяком удобном случае. В январе 1918 г. он обратился с посланием к пастырям Пермской епархии, в котором наставлял их быть руководителями совести народной. С феврале 1918 г., после публикации декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви», в Пермской епархии началось закрытие храмов, разорение духовных учебных заведений, изъятие церковных ценностей. После краткого пребывания в Перми Андроник вернулся в Москву и 12 апреля 1918 г. указом Тихона был возведён в сан архиепископа.