Считалось обыкновенным, чтобы личные («келейные») средства архиереев употреблялись на постройку и украшение церквей, приобретение предметов для архиерейской ризницы, книг, на раздачу милостыни, вклады в монастыри и т.д. Однако грань между келейными деньгами архиерея и домовой казной архиерейского дома зачастую трудноразличима, поэтому в XVIII в. некторые архиереи обвинялись в значительных финансовых злоупотреблениях: Антоний (Черновский), Георгий (Дашков), Варлаам (Леницкий), Сильвестр (Холмский), Лаврентий (Горка), Гедеон (Криновский). В 1762 г. на населенных землях, принадлежавших архиерейскому дому, числилось 166 918 крестьянских душ. По свидетельству Котошихина, церкви принадлежало 118 000 дворов, а иностранцы считали, что в церковном владении находится полвина всей государственной территории. Однако секуляризация, окончательно оформленная манифестом Екатерины II от 26 февраля 1764 г., совершенно изменила общий строй епархиально-владельческого управления в Русской церкви. В результате населенные земли, принадлежавшие архиерейским кафедрам и монастырям, были переведены в собственность казны, архиерейский дом из крупного владельца недвижимых имуществ превратился в собственника нескольких десятин земли и леса или же в арендатора своих прежних имений. В это время все церковные вотчины, имевшие 910 866 душ, были изъяты из церковного ведомства, а епископские кафедры были разделены на три класса. Тогда же был установлен и штат для архиерейских домов. Сумма, предназначавшаяся на их содержание, была получена исходя из расчета по 1 рублю взамен каждой крестьянской души, но затем уменьшена в целом на 16 332 рубля. Архиерейским домам 1-го класса было установлено содержание: санкт-петербургскому – 15 тыс. рублей, новгородскому – около 11 тыс. рублей, московскому – около 7500 рублей. На содержание архиерейских домов 2-го класса (их было 8) отпускалось в среднем по 5500 рублей, 3-го класса (их было 15) – по 3232 рубля. Кроме того, отдельные средства предназначались на содержание некоторых кафедр и викариев. Окладные сборы с духовенства и церквей в архиерейскую казну были отменены. В 1764–1787 гг. архиерейские дома получали штатное жалованье из Коллегии экономии, с 1787 г. – из ведомства Казенных палат. В 1786 г. были составлены штаты для украинских епархий: Киевской (митрополия приравнена к Московской), Черниговской, Новгород-Северской, с ассигнованием на все 70264 рубля. В 1788 г. последовало запрещение испрашивать из казны пособия на починку епархиальных зданий, но предписывалось производить ее на положенные оклады. После секуляризации церковных имений (в 1764 г., а в юго-западной, Киевской Руси в 1786 г.) архиерейские дома совершенно утратили свое прежнее церковно-административное значение, превратившись просто в резиденцию епархиального владыки, с конторой при ней, ведающей, под руководством эконома, доходами от штатных земельных и других угодий, а также хозяйственным бюджетом по содержанию архиерея и его свиты, архиерейского хора (обычно со школой для малолетних певчих) и небольшого штата монашествующего духовенства при крестовой архиерейской церкви. На бедственное положение архиерейских домов обратило внимание правительство Павла I. В 1797 г. было издано распоряжение об увеличении вдвое земельных владений кафедр (не менее 60 десятин) и об отводе им в собственность мельниц, рыбных ловель и разных угодий. Указ Сената от 19 июля 1798 г. подтвердил неотъемлемость недвижимых владений архиерейских домов.