О постройке церкви «армянского закона» в Санкт-Петербурге хлопотал и Лука Ширванов. На это ходатайство в 1740 г. дано императорское разрешение, отмененное при Елизавете Петровне (1742 г.). В достройке начатой в Санкт-Петербурге каменной церкви было также отказано (в 1745 г.). После упомянутого указа императрицы Екатерины II в Санкт-Петербурге началось строительство армянского храма великомученицы Екатерины на Невском проспекте (1771 г.). Оно велось по инициативе и на средства И. Лазарева и было завершено в начале 1780 г. Эта однокупольная церковь явилась образцом русского раннего классицизма. 18 февраля 1780 г. армянский храм освятил архиепископ Иосиф в присутствии князя Г.А. Потемкина и многих высокопоставленных лиц. В 1783 г. в Петербурге открылась первая в России армянская типография, позднее перевезенная в Астрахань. Последние годы XIX в. были тяжелым временем для армянского народа. Гонения со стороны Оттоманской империи особенно усилились с 1894 г. Беженцы-армяне из Турции оседали не только в Южной России, но и в Киеве и в Санкт-Петербурге. В 1895 г. Санкт-Петербург посетил католикос Мкртич I (1892–1907 гг.). Этот выдающийся деятель Армянской церкви был принят императором и присутствовал за богослужениями в армянском храме великомученицы Екатерины. Еще в правление императора Павла I была построена армянская церковь Воскресения Христова на Смоленском армянском кладбище в Санкт-Петербурге (освящена в 1797 г.). При храме была устроена родовая усыпальница Лебедевых. Со временем здесь же были похоронены потомки рода Лорис-Меликовых, профессор турецкого языка Ованес Амиди (1788–1849 гг.), историк и филолог А.М. Худобашев (1780–1869 гг.), сохранилось надгробие профессора К.П. Патканова (1833–1889 гг.). В начале 30-х гг. были снесены два из трех армянских храмов в Москве (кроме Воскресенской церкви на Армянском кладбище). В 30-х гг. XX в. был закрыт армянский храм великомученицы Екатерины в Ленинграде (в дальнейшем использовался под хозяйственные нужды). Армянский храм при Смоленском кладбище был закрыт в 1931 г.; здание использовалось разными организациями. В 1988 г. храм был возвращен армянской общине, в нем было возобновлено богослужение и одновременно начаты реставрационные работы. 1 марта 1993 г. армянской общине был передан храм великомученицы Екатерины в Санкт-Петербурге. 14 марта того же года священник Езрас Нерсесян совершил здесь первое после 60-летнего перерыва богослужение. Интерьеры церкви находились в крайне запущенном состоянии: пропала вся церковная утварь, исчез иконостас, мраморный пол был разобран. Реставрацию храма завершили к 1700-летию принятия Арменией христианства (2001 г.), 12 июля 2000 г. состоялось освящение церкви в присутствии католикоса всех армян Гарегина II и патриарха Московского и всея Руси Алексия II. В 1993 г. армянской общине Москвы выделен участок в центре города для строительства нового храма во имя Воздвижения Честного и Животворящего Креста Господня; после проведения конкурса проектов (1993–2001 гг.) здесь начаты строительные работы.