В 1994 г. ей передана церковь Св. Екатерины в Москве в качестве подворья. Автокефальная православная церковь в Америке осуществляет обширную издательскую деятельность, имеет несколько периодических изданий на различных языках (самое популярное из них – газета Orthodox Churh of America), несколько сайтов в Интернете. Всего в США 12 епархий и 623 прихода. Этнические епархии распространяются и на Канаду – 91 приход. К церкви относится Мексиканский экзархат, в котором 9 приходов и миссий и 5 приходов в Южной Америке, кроме того, есть 3 прихода в Австралии. По Уставу, принятому Вторым Всеамериканским церковным собором в 1971 г., «Православная Церковь в Америке есть автокефальная церковь с территориальной юрисдикцией в США и Федерации Канады». Возглавляет церковь митрополит. В настоящее время во главе церкви стоит митрополит Герман (Свайко, род. в 1932 г.), избранный в июле 2002 г. Он имеет титул «Архиепископ Вашингтонский, митрополит всея Америки и Канады». Его резиденция находится в Сайоссете (штат Нью-Йорк). Высшей канонической властью обладает Священный синод, в который входят все епископы. Между его сессиями действует малый Синод (не менее 3-х епископов). Постоянным исполнительным органом служит Митрополичий совет. При малом Синоде функционируют вспомогательные органы, советы и комиссии, такие как: экономического развития, внешних сношений, истории и архивов, капелланства, богословского образования и др. Каждой отдельной епархией управляет епископ с помощью Епархиального съезда и Епархиального совета. Среди епископов церкви первенством обладает митрополит, в случае вакансии избираемый Всеамериканским собором. Это – орган высшей административной и законодательной церковной власти. Созывается раз в два года из представителей высшего духовенства, рядовых священников, богословов, делегатов местных общин. Между Всеамериканскими соборами созываются также совещания канонических православных епископов. Первое в третьем тысячелетии подобное совещание состоялось 1–3 мая 2001 г. Среди прочих на нем поднимались вопросы о единстве Автокефальной православной церкви в Америке, роли электронных средств массовой информации в современной церковной жизни и др. В церкви существует специальный институт военных православных священников для военнослужащих православного вероисповедания. Церковь состоит членом Всемирного Совета Церквей и членом Национального Совета Церквей Христа в США. Официальным языком литургий является английский язык. В целом же иерархическая структура Автокефальной православной церкви в Америке, а также богослужения схожи с другими православными церквами. Церковь находится в литургическом общении с другими православными церквами в Америке. Ее епископы  принимают участие в Постоянной конференции канонических православных епископов Америки. Церковь поддерживает постоянные контакты с Русской православной церковью. На это указывают совместные литургии и встречи предстоятелей.