По вопросу об участии РПЦ во Всемирном Совете Церквей были сделаны следующие выводы: необходимо вынести на межправославное обсуждение весь комплекс вопросов, связанных с участием представителей православных церквей в контактах с инославным миром и в работе в международных христианских организациях, эта деятельность должна быть строго регламентирована. Давая оценку «Второго общего заявления» Смешанной комиссии по богословскому диалогу между православными церквами и Древними Восточными (дохалкидонскими) церквами, принятого в Шамбези в сентябре 1990 г., митрополит Филарет предложил не рассматривать это заявление как полное и исчерпывающее положение православной христологии и перенести изучение вопросов, связанных с диалогом, на всеправославный уровень, имея в виду и широкое обсуждение в кругах духовенства, богословов и мирян РПЦ. В определении Собора по докладу митрополита Филарета подчёркивалось, что смущение, которое производят в православной среде практика так называемых экуменических богослужений и возникновение новых тенденций в богословии и практике западного протестантизма, выразившихся в принятии женского священства, в употреблении «инклюзивного языка», приводящего к искажению библейского текста, в пересмотре новозаветных нравственных норм, регулирующих отношения между полами, делает необходимым межправославное обсуждение всего комплекса вопросов, связанных с участием представителей православных церквей в контактах с инославным миром, в частности, в двусторонних богословских диалогах, в работе ВСЦ и других международных христианских организаций. Доклад исполняющего обязанности председателя Учебного комитата и ректора Московских духовных школ епископа Евгения был посвящён проблемам богословского образования, которые заключаются, в частности, в нехватке преподавательских кадров, снижении числа рукоположений среди выпускников духовных семинарий и финансовых трудностях. После докладов состоялась дискуссия. Острокритический характер носило выступление Львовского епископа Августина (Маркевича). Рассказав о трагической ситуации в его епархии и во всей Галиции, он упрекал собратьев-архипастырей в недостаточном противостоянии униатскому прозелитизму. Кроме того, епископ Августин дал жёсткую характеристику проявлениям неообновленчества. Критическое отношение к экуменизму выразили в своих выступлениях Уфимский епископ Никон (Васюков) и Тернопольский епископ Сергий (Генсицкий). Постоянные члены Священного Синода митрополит Смоленский Кирилл, митрополит Крутицкий Ювеналий и архиепископ Солнечногорский Сергий (Фомин), хотя и полемизировали между собой в оценке эффективности участия представителей Русской церкви в деятельности ВСЦ в прошлом, в основном, высказались за то, чтобы РПЦ оставалась в ВСЦ. Их поддержали Уральский  епископ Антоний (Москаленко) и Зарайский епископ Павел (Пономарёв), управляющий приходами Московского патриархата в США.